Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAPOLBQ9NRJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPOLBQ9NRJ5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms