Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX0

PRDM6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM6Q9NQX0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM6Q9NQX0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM6Q9NQX0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM6Q9NQX0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms