Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZCCHC17Q9NP64 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms