Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF4Q9BZC1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF4Q9BZC1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF4Q9BZC1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms