Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NIFKQ9BYG3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIFKQ9BYG3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms