Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PYGO2Q9BRQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PYGO2Q9BRQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms