Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms