Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYD88Q99836 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYD88Q99836 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms