Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
INPP4AQ96PE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms