Protein–RNA interactions for Protein: Q96M34

C3orf30, Uncharacterized protein C3orf30, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf30Q96M34 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf30Q96M34 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf30Q96M34 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms