Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms