Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
COG3Q96JB2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
COG3Q96JB2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms