Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC47Q96A33 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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