Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CELF1Q92879 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CELF1Q92879 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CELF1Q92879 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms