Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms