Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL3Q8N8U3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL3Q8N8U3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL3Q8N8U3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms