Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNE4Q8N205 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNE4Q8N205 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms