Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE3Q8IX30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE3Q8IX30 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE3Q8IX30 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE3Q8IX30 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE3Q8IX30 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE3Q8IX30 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE3Q8IX30 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE3Q8IX30 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE3Q8IX30 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms