Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNI2Q6ZMN8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNI2Q6ZMN8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms