Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L3Q6VB84 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L3Q6VB84 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms