Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1Q6P1K2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms