Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms