Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms