Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FHOD3Q2V2M9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FHOD3Q2V2M9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FHOD3Q2V2M9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms