Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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EXT1Q16394 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXT1Q16394 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXT1Q16394 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXT1Q16394 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXT1Q16394 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXT1Q16394 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXT1Q16394 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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EXT1Q16394 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXT1Q16394 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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EXT1Q16394 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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EXT1Q16394 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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EXT1Q16394 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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EXT1Q16394 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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EXT1Q16394 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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EXT1Q16394 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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EXT1Q16394 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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EXT1Q16394 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT1Q16394 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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