Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA1Q15788 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
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