Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SHROOM2Q13796 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SHROOM2Q13796 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
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