Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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