Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPARAQ07869 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms