Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFF3Q07654 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms