Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREMQ03060 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREMQ03060 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREMQ03060 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREMQ03060 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREMQ03060 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREMQ03060 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREMQ03060 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREMQ03060 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREMQ03060 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CREMQ03060 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREMQ03060 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREMQ03060 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREMQ03060 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CREMQ03060 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREMQ03060 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREMQ03060 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREMQ03060 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREMQ03060 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREMQ03060 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREMQ03060 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREMQ03060 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREMQ03060 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREMQ03060 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREMQ03060 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREMQ03060 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREMQ03060 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREMQ03060 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREMQ03060 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREMQ03060 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREMQ03060 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREMQ03060 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREMQ03060 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREMQ03060 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREMQ03060 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREMQ03060 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREMQ03060 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREMQ03060 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREMQ03060 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREMQ03060 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREMQ03060 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CREMQ03060 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREMQ03060 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREMQ03060 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms