Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL23P62829 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL23P62829 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL23P62829 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL23P62829 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL23P62829 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL23P62829 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL23P62829 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL23P62829 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL23P62829 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL23P62829 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL23P62829 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL23P62829 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL23P62829 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL23P62829 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL23P62829 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL23P62829 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL23P62829 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL23P62829 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms