Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP54P61011 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP54P61011 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP54P61011 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP54P61011 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP54P61011 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP54P61011 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP54P61011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP54P61011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP54P61011 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP54P61011 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP54P61011 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP54P61011 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP54P61011 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP54P61011 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP54P61011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP54P61011 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRP54P61011 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP54P61011 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP54P61011 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP54P61011 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP54P61011 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP54P61011 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP54P61011 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP54P61011 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP54P61011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP54P61011 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP54P61011 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP54P61011 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms