Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AIF1P55008 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIF1P55008 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIF1P55008 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIF1P55008 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIF1P55008 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIF1P55008 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AIF1P55008 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AIF1P55008 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AIF1P55008 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AIF1P55008 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AIF1P55008 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AIF1P55008 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AIF1P55008 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AIF1P55008 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AIF1P55008 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AIF1P55008 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AIF1P55008 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AIF1P55008 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AIF1P55008 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AIF1P55008 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AIF1P55008 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AIF1P55008 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AIF1P55008 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AIF1P55008 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AIF1P55008 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AIF1P55008 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AIF1P55008 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AIF1P55008 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AIF1P55008 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AIF1P55008 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AIF1P55008 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AIF1P55008 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AIF1P55008 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AIF1P55008 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AIF1P55008 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AIF1P55008 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AIF1P55008 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AIF1P55008 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AIF1P55008 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AIF1P55008 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms