Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP11P51784 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP11P51784 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP11P51784 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP11P51784 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP11P51784 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP11P51784 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP11P51784 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP11P51784 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP11P51784 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP11P51784 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP11P51784 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP11P51784 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP11P51784 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP11P51784 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP11P51784 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP11P51784 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP11P51784 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP11P51784 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP11P51784 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP11P51784 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP11P51784 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP11P51784 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP11P51784 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP11P51784 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP11P51784 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP11P51784 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP11P51784 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP11P51784 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP11P51784 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP11P51784 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP11P51784 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP11P51784 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP11P51784 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP11P51784 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP11P51784 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP11P51784 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP11P51784 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP11P51784 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP11P51784 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP11P51784 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP11P51784 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP11P51784 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP11P51784 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP11P51784 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP11P51784 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP11P51784 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP11P51784 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP11P51784 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP11P51784 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP11P51784 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP11P51784 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP11P51784 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP11P51784 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP11P51784 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP11P51784 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP11P51784 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP11P51784 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP11P51784 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP11P51784 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP11P51784 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP11P51784 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP11P51784 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP11P51784 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP11P51784 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP11P51784 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP11P51784 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms