Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD8P48556 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.4 ms