Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCG1P45844 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms