Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms