Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARSP41250 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARSP41250 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARSP41250 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARSP41250 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARSP41250 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARSP41250 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARSP41250 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARSP41250 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARSP41250 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARSP41250 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARSP41250 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARSP41250 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARSP41250 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARSP41250 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GARSP41250 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GARSP41250 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GARSP41250 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARSP41250 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARSP41250 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARSP41250 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARSP41250 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARSP41250 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARSP41250 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARSP41250 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARSP41250 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARSP41250 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARSP41250 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARSP41250 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARSP41250 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARSP41250 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GARSP41250 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARSP41250 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GARSP41250 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GARSP41250 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARSP41250 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARSP41250 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARSP41250 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms