Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNFP41002 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNFP41002 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNFP41002 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNFP41002 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNFP41002 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNFP41002 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNFP41002 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNFP41002 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNFP41002 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCNFP41002 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNFP41002 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNFP41002 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNFP41002 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNFP41002 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNFP41002 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNFP41002 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNFP41002 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNFP41002 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms