Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLNP26678 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLNP26678 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLNP26678 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLNP26678 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLNP26678 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLNP26678 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLNP26678 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLNP26678 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLNP26678 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLNP26678 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLNP26678 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLNP26678 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLNP26678 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLNP26678 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PLNP26678 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLNP26678 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLNP26678 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLNP26678 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLNP26678 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLNP26678 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLNP26678 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLNP26678 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLNP26678 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLNP26678 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLNP26678 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLNP26678 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLNP26678 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLNP26678 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLNP26678 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLNP26678 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms