Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGA1P17096 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGA1P17096 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGA1P17096 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGA1P17096 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGA1P17096 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGA1P17096 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGA1P17096 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms