Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HPGDP15428 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPGDP15428 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPGDP15428 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HPGDP15428 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPGDP15428 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HPGDP15428 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPGDP15428 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPGDP15428 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPGDP15428 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPGDP15428 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPGDP15428 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPGDP15428 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPGDP15428 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPGDP15428 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPGDP15428 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPGDP15428 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HPGDP15428 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPGDP15428 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPGDP15428 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPGDP15428 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPGDP15428 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPGDP15428 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPGDP15428 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPGDP15428 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPGDP15428 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPGDP15428 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPGDP15428 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPGDP15428 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPGDP15428 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPGDP15428 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HPGDP15428 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPGDP15428 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPGDP15428 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms