Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms