Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms