Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms