Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEFLP07196 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFLP07196 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFLP07196 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFLP07196 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFLP07196 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFLP07196 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFLP07196 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFLP07196 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFLP07196 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFLP07196 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFLP07196 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFLP07196 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFLP07196 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFLP07196 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFLP07196 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFLP07196 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFLP07196 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFLP07196 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NEFLP07196 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFLP07196 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFLP07196 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFLP07196 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFLP07196 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFLP07196 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFLP07196 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFLP07196 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFLP07196 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFLP07196 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEFLP07196 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEFLP07196 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEFLP07196 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEFLP07196 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEFLP07196 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFLP07196 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFLP07196 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFLP07196 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFLP07196 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFLP07196 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFLP07196 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFLP07196 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFLP07196 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFLP07196 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFLP07196 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFLP07196 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFLP07196 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFLP07196 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFLP07196 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms