Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRNPP04156 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRNPP04156 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRNPP04156 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRNPP04156 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRNPP04156 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRNPP04156 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRNPP04156 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRNPP04156 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRNPP04156 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRNPP04156 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRNPP04156 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRNPP04156 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRNPP04156 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRNPP04156 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRNPP04156 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRNPP04156 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRNPP04156 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRNPP04156 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRNPP04156 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRNPP04156 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRNPP04156 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRNPP04156 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRNPP04156 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms