Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6AO75865 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC6AO75865 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms