Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX16O60231 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX16O60231 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX16O60231 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX16O60231 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX16O60231 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX16O60231 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX16O60231 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX16O60231 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX16O60231 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX16O60231 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DHX16O60231 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DHX16O60231 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DHX16O60231 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX16O60231 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX16O60231 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX16O60231 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX16O60231 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX16O60231 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX16O60231 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX16O60231 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX16O60231 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX16O60231 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX16O60231 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX16O60231 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX16O60231 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX16O60231 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX16O60231 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX16O60231 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX16O60231 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX16O60231 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX16O60231 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX16O60231 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX16O60231 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX16O60231 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX16O60231 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX16O60231 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX16O60231 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX16O60231 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DHX16O60231 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DHX16O60231 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DHX16O60231 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX16O60231 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX16O60231 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX16O60231 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX16O60231 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX16O60231 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms